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从细菌GFF文件提取CDS序列并转换为氨基酸序列
最近在上生物信息学原理,打算记录一些课上的作业。第一次作业:如题。 基本思路: 1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息。GFF格式见 http://blog.sina.com.cn/s/blog_8a4f556e0102yd3l.html. 2.利用起始/终止位置等信息从FNA文件中提取CDS序列。FNA格式见 ht...
2018-06-17 23:39:29
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洗礼灵魂,修炼python(69)--爬虫篇—番外篇之feedpa
feedparser模块 1.简介 feedparser是一个Python的Feed解析库,可以处理RSS ,CDF,Atom 。使用它我们可从任何 RSS 或 Atom 订阅源得到标题、链接和文章的条目了。 RSS(Really Simple Syndication,简易信息聚合) :是一种描述和同步网站内容的格式你可以认为是一种定制...
2018-06-17 23:39:23
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【Python】三个例子教你写代码
这篇文章包括用Python编写的斐波那契数列,三位数的水仙花数和百钱买百鸡的基础代码: (一)斐波那契数列: ''' def hanshu(n): n_1 = 1 n_2 = 1 m = n sumn = 0 for a in range(1,m+1): if m == 1: return n_1 if m== 2: return n_2 sumn = n_1 + n_2 n_2 = n_1 n_1...
2018-06-17 23:39:15
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Python 初始—(多级字典)
字典中 嵌套字典 如同json 对象, data={ "msg":{ “xxx.com”:["a","b"] } } data.values();#打印所有的值,不包括key data["meg"][“xxx.com”][1]=c;#b值变成c data.setdefault(key,value);#如果在字典中没有找到该key ,则创建一个默认 data.update();#把两个字典...
2018-06-17 23:39:24
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面向对象5-反射
hasattr(x, y) getattr(x, y) setattr(x, y , v) delattr(x, y)四种反射方法,就是把字符串反射为内存地址。 1 class people(object): 2 def __init__ (self, name, age): 3 self.name = name 4 self.age = age 5 6 def talk(self): 7 print ( ' %s is talking ... ' %...
2018-06-17 23:39:18
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洗礼灵魂,修炼python(68)--爬虫篇—番外篇之webbro
题外话: 爬虫学到这里,我想你大部分的网站已经不再话下了对吧?有检测报文头的,我们可以伪造报文头为浏览器,有检测IP,我们可以用代理IP,有检测请求速度的,我们可以用time模块停顿一下,需要登录验证的,我们可以用cookielib模块搞定登录,HTML标签嵌套太多层的...
2018-06-17 23:39:15
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Python第一天自学,变量,基本数据类型
PyCharm 一些简单常用设置操作 设置模板 File-Settings-Editor-File and Code Templates //切换python版本 File-settings-Project interpreter -选择版本 #!use/bin/env python # -*- coding:utf-8 -*- #设置utf-8编码 var=1 ca=2 ca+=var print(ca) #python 运算符基...
2018-06-17 23:39:12
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python中以下划线变量,使用说明
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2018-06-17 23:39:11
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pandas合并数据集-【老鱼学pandas】
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2018-06-17 23:39:09
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python中的shallow copy 与 deep copy
今天在写代码的时候遇到一个奇葩的问题,问题描述如下: 代码中声明了一个list,将list作为参数传入了function1()中,在function1()中对list进行了del()即删除了一个元素。 而function2()也把list作为参数传入使用,在调用完function1()之后再调用function2()就出现了...
2018-06-17 23:39:05
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