linux_x86_64 blat安装

2018-08-14 09:54:33来源:博客园 阅读 ()

新老客户大回馈,云服务器低至5折

按网上版本,没能运行成功,主要是环境变量里路径设置错误,红字为更改的部分

blatSrc35.zip下载地址:http://users.soe.ucsc.edu/~kent/src/

对于下载好的源代码安装包blatSrc35.zip,需进行编译,安装过程如下:

1.用unzip blatSrc35.zip 解压缩包;

2.bash:cd blatSrc 进入blatSrc文件夹下(此后直到设置环境变量,都在blatSrc文件夹下操作);

3.bash:uname -a  查看linux系统类型,我的系统是x86_64 GUN/LINUX;

4.bash:export MACHTYPE=x86_64 回车;

5.bash:mkdir -p ~/bin/x86_64 回车;

6.bash:make 回车;

7.设置环境变量:主目录下(/home/2188) bash:vim .bashrc;

8.按”i”,编辑文档,最后行输入:export PATH=/home/2188/bin/x86_64:$PATH,编辑完成后Esc,:,wq,回车;(如果输入export PATH=/home/2188/bin:$PATH,运行时不能成功,还需加./blat才能运行)

9.bash:source .bashrc更新环境变量。

至此blat安装完毕 bash:blat *.fa **.fa 回车即以**.fa为 母库比对。

标签:

版权申明:本站文章部分自网络,如有侵权,请联系:west999com@outlook.com
特别注意:本站所有转载文章言论不代表本站观点,本站所提供的摄影照片,插画,设计作品,如需使用,请与原作者联系,版权归原作者所有

上一篇:linux上面安装svn步骤

下一篇:nmap